西农大:首次测定奶山羊乳腺转录组

  • 日期:01-18
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奶山羊不仅是重要的奶源,而且在发展中国家发挥着重要的农业和经济作用。了解山羊乳腺的遗传背景对于研究控制组织功能和乳成分合成的调控机制具有重要意义。然而,缺乏完整的山羊乳腺转录组信息阻碍了相关工作。为此,西北农林大学罗俊教授领导的团队对奶山羊乳腺组织转录组进行了全面测量和深入分析,相关结果发表在最近的Functogr Genomics上。

Luo教授的团队从山羊乳腺发育的四个不同阶段收集组织,通过转录组denovo测序确定其转录组,共产生约25GB的序列信息(转录组denovo测序项目由莲川生物承担)。序列拼接获得51,361个单基因,其中约60.07%的单基因与天然橡胶数据库中的蛋白质有同源性。KOG、GO和KEGG的进一步功能分类显示,山羊乳腺的单基因参与多种生物过程和代谢途径,包括脂质代谢和乳糖代谢。定量聚合酶链反应发现编码FABP3、FASN、SCD、PLIN2、乳清蛋白(LALBA和BLG)和酪蛋白(CSN1S1、CSN1S2、CSN2和CSN3)的基因在产后100天和310天与非哺乳期相比显着过量表达。除了它们在脂质和蛋白质合成中的作用,分娩后310天的高表达可能有助于怀孕期间乳腺细胞的更新。

*HShi,JZU,JLo,WCao,HShi,DYao,JLi,YSun,HXu,KYu,JLoor(2014)Genes Regulatinglipandproteinmethography highly expressed edingmammaryglandflactingdairyshengs。func . int . genomics . epubaheadofPrindoi:10.1007/s -014-0420-1[文章]

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